GC kiekis

G/C kiekis – molekulinėje biologijoje naudojamas rodiklis, guanino arba citozino nukleobazių procentinė dalis tiriamo organizmo DNR arba RNR. Šis rodiklis gali būti pamatuojamas keliais būdais, pvz., matuojant DNR lydymosi temperatūrą ar būdais.

GC kiekis varijuoja nuo 20 % iki beveik 80 % bakterijose, 26 - 61 % archeobakterijose, 35 -45 % gyvūnuose, 33 - 48 % augaluose, 36-67 % dumbliuose, 20-60 % grybuose, 20-66 % vienaląsčiuose (skaičiai +/-2 % tikslumu).

Vienodas GC kiekis gali parodyti lyginamų organizmų sąryšį priklausomai nuo situacijos, tačiau jei šis kiekis skiriasi daugiau nei 5 %, organizmai greičiausiai nesusiję. GC kiekis taip pat naudojamas PGR metoduose.

Apskaičiavimas

G/C kiekis (procentinė vertė) apskaičiuojamas pagal formulę:

${\displaystyle {\cfrac {G+C}{A+T+G+C}}\times \ 100}$

Gali būti naudojamas ir GC santykis, kurio formulė:

${\displaystyle {\cfrac {A+T}{G+C}}}$.

Šaltiniai

1. Madigan, MT. and Martinko JM. (2003). Brock biology of microorganisms (10th leid.). Pearson-Prentice Hall. .
2. Definition of GC-ratio on Northwestern University, IL, USA 2010-06-20 iš Wayback Machine projekto.